Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HDAC8Q9BY41 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC8Q9BY41 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC8Q9BY41 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC8Q9BY41 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC8Q9BY41 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC8Q9BY41 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC8Q9BY41 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC8Q9BY41 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC8Q9BY41 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC8Q9BY41 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC8Q9BY41 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC8Q9BY41 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HDAC8Q9BY41 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms