Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A3Q9BRY0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms