Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms