Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELF4Q99607 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms