Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RIT2Q99578 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms