Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms