Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD4Q96M96 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms