Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms