Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VTI1AQ96AJ9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms