Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
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