Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL11Q8NHH1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL11Q8NHH1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms