Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
WDR53Q7Z5U6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms