Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT28Q7Z3Y7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms