Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms