Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms