Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q6P435 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q6P435 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q6P435 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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