Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SDE2Q6IQ49 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SDE2Q6IQ49 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SDE2Q6IQ49 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SDE2Q6IQ49 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms