Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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TNS3Q68CZ2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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TNS3Q68CZ2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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TNS3Q68CZ2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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TNS3Q68CZ2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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TNS3Q68CZ2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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TNS3Q68CZ2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
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TNS3Q68CZ2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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TNS3Q68CZ2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNS3Q68CZ2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNS3Q68CZ2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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