Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RSPH4AQ5TD94 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms