Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS72Q15906 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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