Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNHIT3Q15649 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNHIT3Q15649 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms