Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PDK1Q15118 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PDK1Q15118 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PDK1Q15118 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PDK1Q15118 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PDK1Q15118 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDK1Q15118 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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