Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53BQ14153 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms