Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNGB1Q14028 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNGB1Q14028 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms