Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXE3Q13461 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXE3Q13461 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXE3Q13461 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXE3Q13461 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXE3Q13461 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXE3Q13461 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXE3Q13461 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXE3Q13461 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FOXE3Q13461 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXE3Q13461 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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FOXE3Q13461 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXE3Q13461 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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