Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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FOXC1Q12948 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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FOXC1Q12948 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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FOXC1Q12948 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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FOXC1Q12948 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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FOXC1Q12948 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXC1Q12948 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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FOXC1Q12948 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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FOXC1Q12948 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXC1Q12948 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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