Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EFEMP1Q12805 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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EFEMP1Q12805 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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EFEMP1Q12805 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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EFEMP1Q12805 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EFEMP1Q12805 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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