Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPSF1Q10570 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF1Q10570 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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