Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4CQ08493 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms