Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CXCL9Q07325 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms