Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL16A1Q07092 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COL16A1Q07092 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms