Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1P60507 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1P60507 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms