Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB4P54760 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB4P54760 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB4P54760 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB4P54760 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB4P54760 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB4P54760 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB4P54760 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB4P54760 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB4P54760 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB4P54760 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB4P54760 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB4P54760 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB4P54760 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EPHB4P54760 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB4P54760 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB4P54760 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB4P54760 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB4P54760 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB4P54760 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB4P54760 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHB4P54760 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB4P54760 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB4P54760 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHB4P54760 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHB4P54760 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHB4P54760 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB4P54760 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB4P54760 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms