Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPAP53621 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPAP53621 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPAP53621 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPAP53621 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPAP53621 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPAP53621 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPAP53621 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPAP53621 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPAP53621 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COPAP53621 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COPAP53621 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COPAP53621 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
COPAP53621 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPAP53621 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms