Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP1P53367 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP1P53367 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms