Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK1EP49674 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms