Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NESP48681 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NESP48681 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NESP48681 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NESP48681 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NESP48681 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NESP48681 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NESP48681 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NESP48681 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NESP48681 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NESP48681 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NESP48681 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NESP48681 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NESP48681 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NESP48681 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NESP48681 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NESP48681 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NESP48681 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NESP48681 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
NESP48681 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NESP48681 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
NESP48681 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NESP48681 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
NESP48681 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NESP48681 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NESP48681 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NESP48681 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
NESP48681 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NESP48681 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NESP48681 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
NESP48681 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NESP48681 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NESP48681 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NESP48681 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NESP48681 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NESP48681 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NESP48681 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NESP48681 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NESP48681 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms