Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTRNP46939 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTRNP46939 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTRNP46939 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTRNP46939 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTRNP46939 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UTRNP46939 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms