Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PIK3CBP42338 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms