Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL9P32969 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL9P32969 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms