Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms