Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRMP28827 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
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