Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD10P28358 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD10P28358 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD10P28358 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD10P28358 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms