Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
APCP25054 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APCP25054 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APCP25054 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APCP25054 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APCP25054 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
APCP25054 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APCP25054 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
APCP25054 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APCP25054 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APCP25054 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APCP25054 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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