Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRAP18433 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRAP18433 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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