Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BMP3P12645 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BMP3P12645 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BMP3P12645 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BMP3P12645 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BMP3P12645 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BMP3P12645 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BMP3P12645 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BMP3P12645 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BMP3P12645 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms