Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCRP11274 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCRP11274 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCRP11274 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCRP11274 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCRP11274 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCRP11274 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCRP11274 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCRP11274 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCRP11274 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCRP11274 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCRP11274 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCRP11274 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCRP11274 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BCRP11274 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BCRP11274 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCRP11274 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCRP11274 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCRP11274 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCRP11274 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCRP11274 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCRP11274 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCRP11274 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCRP11274 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms