Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POP4O95707 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POP4O95707 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POP4O95707 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POP4O95707 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms