Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BBOX1O75936 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOX1O75936 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms