Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KIAA0556O60303 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms